A causa exata é desconhecida. Uma teoria sugere que durante a menstruação as células do endométrio passariam através das trompas de Falópio para a cavidade peritoneal abdominal, onde se implantariam. Os locais mais comuns de implantação são os ovários, trompas de Falópio, superfície externa do útero e septo reto-vaginal (área entre a vagina e o reto). Outras teorias sugerem alterações do sistema imunológico e mesmo uma herança genética.
A cada menstruação este tecido endometriótico sangra causando dor pélvica, dor durante a relação sexual, queixas urinárias, intestinais e infertilidade.
Os sintomas mais comuns incluem:
 | dismenorréia severa (dor pélvica cíclica que ocorre antes e durante a menstruação) |
| dispareunia (dor durante ou logo após o ato sexual) |
| dor pélvica crônica |
| infertilidade |
| sintomas urinários com micções dolorosas |
| dor na região lombar baixa (costas) |
| desconforto abdominal |
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